Au fur et à mesure des créations, modifications et suppressions de fichiers, les informations ne sont plus stockées de façon contiguë sur le disque. Il se crée une fragmentation des données sur le disque qui ralentit les accès et, par voie de conséquence, tout le système. Tous les versions de Windows sont dotés d'un outil de défragmentation. Mais celui-ci en fait un minimum, réalisant une défragmentation grossière et lente.

UltraDefrag est un outil Open Source doté d'un moteur de défragmentation extrêmement rapide et ultracompact (190 Ko !). Utile avec XP, il se montre indispensable avec Vista, le système ne laissant plus aucun contrôle à l'utilisateur sur les disques à défragmenter et le processus de défragmentation. Le logiciel, en anglais, est très simple d'emploi. Il suffit de sélectionner l'unité de disque à défragmenter, de cliquer sur Analyse pour constater visuellement l'état du disque et de cliquer sur Defragment pour lancer la défragmentation.

La commande Compact ne se contente pas de défragmenter les fichiers, elle défragmente aussi lespace vide pour améliorer les performances en écriture.