Dans Ultratron, vous êtes le seul humanoïde rescapé de la bataille contre les droïdes. Vous décidez de venger la race humaine et d'exterminer les quatre robots de l'Apocalypse : Ieiunitas, Bellum, Lues et Letum. Vous devez donc traverser et passer les différents niveaux en évitant les attaques ennemies pour arriver jusqu'aux robots géants, et tenter de les détruire.