L'action de cette suite se situe en 2006, les États-Unis installent une base militaire temporaire au Timor-Oriental, pour entraîner la force défensive de la "plus jeune démocratie du monde". Sam Fisher va devoir aider l'armée américaine un peu partout dans le monde, pour faire en sorte que Sadono, le chef d'une milice armée qui agit avec le soutien officieux des principales factions corrompues du gouvernement Indonésien, ne soit plus intouchable et que la guérilla soit neutralisée... Le scénario de cette suite a été approuvé par Tom Clancy, l'auteur à l'origine de la série. Le jeu comporte de nombreux effets graphiques pour un réalisme accru et des cinématiques dignes des plus grands films Hollywoodiens ! De nouvelles armes font leur apparition ainsi que de nouvelles techniques d'infiltration. Mais la grande nouveauté de Pandora Tomorrow est l'apparition d'un mode multijoueur dans lequel vous choisirez d'incarner les espions ou les mercenaires. Ces derniers étant déplacés en vue subjectives, alors que les joueurs espions utiliseront une vue à la troisième personne. Les modes proposés (Neutralisation, Extraction et Sabotage) promettent des heures d'affrontement en réseaux.
Note : La démonstration en version solo est disponible ici.