Pour les fans de schémas et de diagrammes fonctionnels, yEd Graph Editor recèle des trésors de fonctions destinées à la fois à personnaliser le moindre détail mais aussi à optimiser la lecture globale. Le programme est très riche en fonctions et en méthode d'organisation : couches hiérarchiques interactives, couches orthogonales, couches organiques, schémas UML, circulaires, en arbre, etc. Bien entendu, les diagrammes générés peuvent être sauvegardés en plusieurs formats dont PDF, Flash, SVG, HTML, EPS ou BMP. Une fonction très utile permet de découper de très grands schémas afin de les imprimer sur plusieurs feuilles et de pouvoir ensuite les assembler entre elles pour reconstituer l'image en grandeur réelle. Développé entièrement en Java, le programme fonctionne indépendamment du système d'exploitation, il a juste besoin d'un machine virtuelle Java.