PeptideShaker

PeptideShaker est un outils sur lequel vous pouvez interroger neuf plates-formes pour l'interprétation de résultats de la protéomique: X! Tandem, MS-GF +, MS Amanda, OMSSA, MyriMatch, Comet, Tide, Mascot et mzIdentML. Cela diminue le risque d'erreurs et garantit que les données sont correctement analysées.

Cependant, avant de traiter des protéines, vous devez vous assurer d’avoir au moins 4 Go de RAM. En outre, la dernière version de Java doit être installée. 

PeptideShaker vous fournit une multitude de données statistiques et descriptives, y compris le nombre de peptides, les séquences de correspondances de spectre et les analyses d'enrichissement de l'ontologie génétique. Le cas échéant, l'application génère des graphiques riches en données sous plusieurs formes, y compris des graphiques à barres et des graphiques à bulles. Lorsque les cas le permettent, les chaînes individuelles sont mises en évidence dans différentes couleurs, ce qui permet des comparaisons rapides entre les ensembles de données.