Alien 3 est un jeu d'action et de plate-forme basé sur le film du même nom. Vous incarnez Ellen Ripley, l’héroïne principale de la saga Alien. Vous commencez votre aventure en hypersommeil à bord du vaisseau l'USS Sulaco de retour de sa mission sur Acheron. Un alien s’est infiltré dans le vaisseau et attaque un des survivants en hybernation, déclenchant une procédure d'évacuation d'urgence de l'appareil. Votre capsule s’écrase sur Fiorina 161. Vous devez prévenir les résidents de la planète et éliminer les aliens présents.