Pénalisé par une interface peu avenante, Comptes bancaires se destine clairement à un public averti. Il dispose notamment de fonctions de compatibilité analytique, avec des graphiques particulièrement complets et lisibles, en plus de fonctions de gestion bien étoffées, avec par exemple, la confrontation du budget réel à un budget de référence défini par l'utilisateur ou encore la publication d'états financiers complets.

En contrepartie, Comptes bancaires laisse souvent l'utilisateur seul, sans aide : le logiciel ne sait pas identifier tout seul les opérations récurrentes et il ne gère pas les opérations intercomptes. Surtout, les fonctions d'importation de relevés de comptes téléchargés sur Internet laissent à désirer : les libellés sont perdus à l'importation des fichiers OFX, ce qui rend la ventilation et le pointage des opérations vraiment fastidieux.