Seul modèle avec un disque de 5 Go séparé en deux partitions, l'une pour la musique, l'autre pour les données, cet appareil évite les mauvaises manipulations ou l'effacement malencontreux des données. Disponible en plusieurs coloris, le Zen Micro adopte un système de pavé tactile inspiré de celui de l'iPod mini, mais moins ergonomique.

Si les menus sont clairs, l'appareil est peu pratique à utiliser : le curseur de navigation haut-bas servant aussi à valider, on se trompe souvent entre navigation et validation et, le pavé tactile est trop sensible, conduisant à d'autres erreurs. Autres points faibles : le Zen Micro nécessite un pilote. A son avantage, il intègre une radio FM et, plus original, il peut être utilisé pendant qu'il est connecté sur le port USB du micro.